Barrett食管的治療方法主要包括藥物治療、內鏡治療和外科手術治療等。

1.藥物治療

主要目的是緩解癥狀、逆轉柱狀上皮為鱗狀上皮及預防并發癥。常用的藥物包括質子泵抑制劑（如奧美拉唑、泮托拉唑等），這些藥物可以抑制胃酸分泌，減輕癥狀。另外，還可以使用促胃腸動力藥（如多潘立酮、鹽酸伊托必利等），這些藥物可以增加食管下括約肌壓力，改善食管蠕動功能，促進胃排空，從而減少胃十二指腸內容物反流并縮短其在食管的暴露時間。以上藥物均需要遵醫囑使用。

2.內鏡治療

隨著內鏡治療技術的發展，近年來內鏡下的消融治療已應用于臨床。常用的內鏡治療方法包括熱消融、化學消融和機械消融。熱消融是利用熱量將病變組織消除；化學消融是通過注射藥物于食管化生處或異型上皮，使局部組織壞死；機械消融則是在內鏡下進行切除，使局部病變消失。

3.外科手術治療

主要適用于內科治療無效、出現并發癥（如食管狹窄、反復發作的消化道潰瘍出血等）及疑似癌變或癌變者。常用的手術方式包括胃底折疊術和食管切除術。胃底折疊術是通過將胃底部分包繞食管下段，增加食管下括約肌的壓力，從而改善反流癥狀；食管切除術則是切除病變的食管，防止癌變。