臨床上并未明確小兒血管瘤的病因，該疾病的發生可能是先天發育異常、早產、藥物因素、環境因素等原因引起的。

1.先天發育異常

患者出現先天發育異常的情況時，其可能會出現血管內皮細胞異常增生的情況，從而導致其出現小兒血管瘤的情況。

2.早產

患者出現早產的情況時，由于機體未完全發育成熟，可造成其局部血管無法正常發育，使其發生小兒血管瘤的可能性變大。

3.藥物因素

女性妊娠早期服用可能會致畸的藥物時，可導致其出現基因突變的情況，引起血管內皮細胞的異常增殖，患者此時也會出現小兒血管瘤的表現。

4.環境因素

女性懷孕期間長期處于被污染的環境中時，可對其胚胎的血管發育造成影響，引發小兒血管瘤的形成。