導致膽結石形成的原因，通常比較復雜，一般臨床上都認為膽結石是多種因素共同作用的結果，比如膽汁的成分、理化性質受到外界的因素影響之后發生改變，導致膽汁中的膽固醇呈一種過飽和的狀態，然后會析出、沉淀并且結晶，形成膽結石。

比如患者長期大量的食用高脂肪、高膽固醇的食物；經常不吃早餐，導致空腹的時間過長，膽囊中的膽汁不能夠及時排出，導致膽固醇結晶，與這些都有關系。

還有個別的研究認為，膽囊結石的病人膽汁中有一種能夠分泌大量黏蛋白的物質，它也能夠促進結石的形成。