肝膽結石形成非常復雜，第1點，膽固醇結石，由于膽汁中膽固醇過飽和，膽汁中膽固醇的成核過程異常導致。第2點，膽囊功能異常，容易形成肝膽結石，肝臟排出膽汁功能障礙，也容易引起肝膽結石形成。

第3點，膽道感染，尤其是肝內細菌感染，肝內華支睪吸蟲感染，容易引起膽管內泥沙樣結石出現。同時革蘭（+）和革蘭（-）桿菌騷擾，促進了膽結石的形成。

第4點，寄生蟲病，如膽道蛔蟲，也容易形成肝膽結石。