抗原以抗原決定簇與相應淋巴細胞的抗原受體結合而激活淋巴細胞引起免疫應答。換言之，淋巴細胞表面的抗原識別受體通過識別抗原決定簇而區分“自身”與“異己”。抗原也是以抗原決定簇與相應抗體特異性結合而發生反應的。因此，抗原決定簇是免疫應答和免疫反應具有特異性的物質基礎。
抗原的結構介紹
抗原在化學結構上與機體自身不同，具有異物性。
①異種物質
從生物進化過程來看，異種動物間的血緣關系越遠，則免疫原性越強。如馬的血清和各種微生物與人的血緣關系遠，所以免疫原性強。而馬的血清與驢、騾的血緣關系近，所以免疫原性相對就弱。
②同種異體物質
如人的紅細胞抗原物質和人的白細胞抗原等。
③自身物質
自身物質一般不具免疫原性。有些物質如隱蔽的自身成分(眼晶體蛋白、精子等)，在正常情況下與免疫系統是隔絕的。但是一旦屏障遭到破壞，這些物質進入血流，即可與免疫活性細胞接觸而成為自身抗原異物。另外，自身物質在外傷、感染、藥物和射線的影響下，其理化性質發生質的改變時，也可成為具有免疫原性的抗原物質。
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