近視眼眼睛疼可能由多種原因引起，如視疲勞、屈光度數變化、眼部疾病等。

1.視疲勞

近視眼患者的眼睛需要不斷調節焦距以看清近處物體，過度調節可能引起眼睛疲勞和疼痛。

2.屈光度數變化

如果近視度數發生了變化，沒有及時配鏡矯正，可能會引起眼睛疲勞和疼痛。

3.眼部疾病

近視眼患者可能會合并青光眼、視網膜病變等疾病，由于眼壓升高、視網膜病變，進而引起眼睛疼痛。

如果近視眼患者出現眼睛疼痛，應及時就醫檢查，以明確具體原因。