甲狀腺疾病包括甲狀腺炎、甲狀腺功能亢進癥、甲狀腺囊腫等，不同的疾病病因也不同。

1、甲狀腺炎

甲狀腺炎一般是由于自身免疫因素以及細菌感染、病毒感染等所致，若接受過大劑量放射碘治療或進行過頭頸外照射治療等，也會誘發甲狀腺炎。

2、甲狀腺功能亢進癥

多結節性毒性甲狀腺腫、甲狀腺自主性高功能腺瘤、碘攝入相對過量、甲狀腺炎等，均可引起甲狀腺功能亢進癥。

3、甲狀腺囊腫

甲狀腺囊腫的病因目前并不十分明確，但研究發現此病與遺傳、生活環境以及代謝性疾病等有關。