營養不良的治療方法有一般治療、藥物治療、手術治療等。

1、一般治療

以補充營養為主，比如干瘦型營養不良應給予高能量飲食；惡性營養不良需要積極調整飲食結構，充分補充能量與優質蛋白，并糾正水和電解質紊亂狀態；繼發性蛋白質能量營養不足則應該盡快治療原發病，補充水分、電解質等。

2、藥物治療

以腸外營養治療為主，藥物包括維生素、葡萄糖、微量元素、氨基酸、脂肪乳劑等。除此之外，還可以適當添加雙歧桿菌、酵母菌、多酶片等消化類藥物。

3、手術治療

一般只針對繼發性蛋白質能量營養不足，比如與癌癥有關的營養不良，需要通過手術切除腫瘤；上消化道梗阻造成的進食障礙患者，需要做胃腸造口術等。