眼睛內有小疙瘩可能是瞼裂斑、翼狀胬肉、結膜色素痣等原因引起的，具體如下：

1、瞼裂斑：患者在年齡、煙塵、紫外線、不合格化妝品刺激等因素作用下，引發瞼裂斑。患病后，患者結膜可能會出現黃色透明的隆起斑塊，可表現為眼睛內有小疙瘩。

2、翼狀胬肉：患者長期受強烈日曬、污染、眼睛炎癥等因素影響，導致翼狀胬肉發生。患者可出現結膜纖維細胞異常增生，從而在角膜邊緣形成胬肉，表現為眼睛內有小疙瘩。

3、結膜色素痣：眼睛可造成局部黏膜充血，導致眼周靜脈循環不暢，使得局部發生色素代謝異常，在眼睛里形成色素痣，可表現為眼睛里有小疙瘩。