膽囊有非常重要的生理功能，膽囊可以通過吸收、分泌以及運動從而發揮出濃縮、儲存以及排出膽汁的作用。首先膽囊雖然容積僅有40ml，但是24小時內能夠接納500ml由肝臟分泌的膽汁。

膽囊黏膜通過吸收水和電解質，從而使膽汁濃縮5-10倍，從初級膽汁變為次級膽汁儲存于膽囊內，以進一步有利于脂類食物的消化。

另外，膽汁的分泌雖然是持續性的，但是膽汁的排放是隨著進食而斷續進行的。它主要是通過膽囊平滑肌的收縮以及oddi括約肌的松弛來實現的，主要受到神經系統和體液因素的調節。

此外膽囊還具有比較重要的分泌功能，膽囊黏膜每天可以分泌20ml的黏液性物質，主要是黏蛋白，它可以潤滑和保護膽囊黏膜，這就造成當膽囊管梗阻時，膽汁內的膽紅素被吸收，膽囊黏膜分泌黏液增加，從而呈現白膽汁。