魚腥草具有消癰排膿、利尿通淋、清熱解毒的功效，可以用于瘡瘍癰毒、四肢浮腫等癥的治療，同時也可以促進腸道蠕動，刺激消化液的產生，改善脾胃虛弱引起的食欲不振、胃脘脹痛、大便不暢等癥狀。

中醫認為魚腥草歸肺經，藥較寒，有腥味。它的作用是可以清熱解毒、消癰排膿，利尿通淋。臨床中一般用于肺癰、吐膿、肺熱咳嗽。痰熱壅肺、胸痛、咳吐膿血，這時一般是肺癰，就配桔梗、蘆根、瓜蔞這些藥排膿。若是肺熱咳嗽、痰黃、氣較急，大便干、舌頭較黃膩、患者比較燥熱，就配黃芩、瓜蔞、知母。魚腥草可以治療熱毒瘡毒，藥外壅瘡毒也常用，配菊花蒲、公英、銀花、連翹一塊用。若在外不方便，魚腥草也可以用鮮品搗爛了用。魚腥草還有一定的清熱化濕的作用，治療濕熱的令癥，善清膀胱濕熱，這時候配車前草、白茅根、海金沙、大小劑，來治療小便的淋漓澀痛。另外，還可以治療清熱、止痢，還可以治療濕熱瀉痢。