女性在服用避孕藥后發生懷孕，會對胎兒生殖器官的生長發育造成影響，但是影響較低，懷孕期間要記得定時去醫院參加產檢，觀察胎兒的生長發育情況，若是異常情況出現時，應該及時進行處理。

緊急避孕藥的主要成分是一種人工合成的孕激素，化學名稱是左炔諾孕酮，孕婦服用孕酮類激素主要對胎兒生殖器官的發育有影響，可使女胎男性化。一般而言，這種情況胎兒可以保住，因為從末次月經算起的4周之內為細胞和組織分化前期，此期一般對各種致畸不敏感，且生殖系統的發育大約在孕8周，由于緊急避孕藥在體內代謝的時間短，約為3天左右，因此從末次月經算起的4周之內服用緊急避孕藥對胎兒的影響不大。