這個問題牽涉到幾方面。首先是衛生經濟學問題。我國居民幽門螺桿菌感染率高達60%—70%，要讓近10億民眾都使用抗生素治療，恐怕人力、物力皆有不濟。在國際上，也沒有全民治療的先例可循。
其次，已有報道，在經抗幽門螺桿菌治療的患者中，食管下段疾病如胃食管反流所致的炎癥，乃至腺癌等，都有增加之勢。
再次，雖然抗菌治療不難，但再感染、復發的機會很多。許多研究表明，人的牙垢中往往藏有幽門螺桿菌，而此處的細菌很難清除。即使胃中的細菌殺滅了，口腔的細菌又會順流而下。更何況，國人經常一起用餐，數人甚至數十人在一個盤子里吃飯，在一個碗中喝湯，口中的細菌自然會相互感染。
所以，目前我國學者的共識是，若已證實患有胃病，并有幽門螺桿菌感染者，需要對癥治療。如果只是查出有感染，但沒有胃病，那就不用治。老百姓自己也要增強正確的治療意識，別花冤枉錢。
