懷孕45天看不到孕囊的原因主要有兩個：一是胚胎著床時間晚，比如受精卵不是在子宮腔內著床，而是在輸卵管等其他地方著床，由于輸卵管營養條件不佳，導致受精卵在輸卵管著床且生長發育不良，從而使其出現較晚；二是異位妊娠，即受精卵在子宮腔外著床，以前稱為宮外孕。如果是異位妊娠卻找不到孕囊，可能是因為血液中人絨毛膜促性腺激素（HCG）相對較低，所以孕囊尚未發育，也可能是由于妊娠處于特殊部位，如腹部妊娠，進而未發現孕囊。

懷孕45天看不到孕囊的注意事項如下：

一、營養方面：

1.要注意攝入充分的營養成分，做到葷素搭配合理。

二、睡眠方面：

1.在孕期要保證充足的睡眠，避免熬夜。

三、飲食方面：

1.要注意清淡飲食，避免食用辛辣刺激的食物。

四、運動方面：

1.可以適當進行運動，以增強身體的抵抗力。

總之，懷孕45天看不到孕囊可能存在多種情況，需要密切關注并做好相應的注意事項。