懷孕3個月有咖啡色分泌物流出可能是以下原因：

1.先兆流產(chǎn)

2.宮頸息肉

3.異位妊娠

4.其他

對于孕婦來說，出現(xiàn)這種情況需要引起重視，應(yīng)及時就醫(yī)，進(jìn)行相關(guān)檢查，如超聲檢查、血β-HCG及孕酮檢測等，以明確原因，并采取相應(yīng)的治療措施。

此外，在等待就醫(yī)的過程中，孕婦應(yīng)注意休息，避免劇烈運動和性生活，保持外陰清潔，避免感染。如果出血量增多或出現(xiàn)腹痛等不適癥狀，應(yīng)立即就醫(yī)。

同時，需要提醒的是，以上內(nèi)容僅供參考，具體情況請以專業(yè)醫(yī)生的診斷為準(zhǔn)。