慢性扁桃體炎和慢性咽炎有以下區別：

一、發病部位不同：慢性咽炎發病時炎癥主要在咽部黏膜，像咽喉壁、前后弓、懸雍垂等部位。而慢性扁桃體炎發作時炎癥主要集中于扁桃體及其周圍組織，病變部位處于前后弓扁桃體窩內。

二、癥狀表現不同：出現慢性咽炎時，喉嚨會有異物感，咳嗽時常有喉嚨癢、干咳以及咳出白色泡沫痰等表現。若是扁桃體炎，則會有喉嚨腫痛，嚴重情況下會出現局部膿點，還可能伴有高熱、頭痛等癥狀。

三、治療方式不同：臨床上慢性扁桃體炎和慢性咽炎的治療都包含保守治療和手術治療。在保守治療方面兩者有相似之處，一般都建議服用抗生素、清咽潤喉藥物進行治療。而在手術治療上有所不同，慢性扁桃體炎的外科治療主要是扁桃體切除術，慢性咽炎的外科處理主要是低溫等離子消融。

總之，當患者出現不適癥狀時，應及時就醫檢查，并在醫生指導下進行治療，切不可私自用藥，以免引發不良反應。