先天性房間隔缺損具有一定的遺傳傾向，家族中有該病患者的人，其患病風險可能會增加。

先天性房間隔缺損可能是常染色體顯性遺傳，這意味著只要一個父母攜帶了突變基因，就有可能將其傳遞給子女。此外，還有一些病例可能與基因突變或其他遺傳因素有關，但具體的遺傳模式還沒有完全明確。如果家族中有先天性房間隔缺損患者，遺傳咨詢可以提供關于遺傳風險和生育建議的信息。

除了遺傳因素外，環境因素也可能在先天性房間隔缺損的發生中起作用。例如，母親在懷孕期間感染病毒、接觸有害物質等可能增加胎兒患心臟病的風險。