小兒尿道下裂可能由胚胎因素、基因遺傳、其他因素導致，有家族史應備孕時做好基因檢測及孕期完善產檢，小兒患病需及時手術。

一、胚胎因素

原始性腺形成后，胚胎睪丸會分泌雄激素和苗勒氏管抑制物質，在胚胎第8周左右進行分化，尿生殖竇進行分離。若此過程中尿道閉合不完全，就會引發尿道下裂。

二、基因遺傳

通常和多基因遺傳相關，重度尿道下裂患者需要進行基因檢測，以明確是否存在基因突變。

三、其他因素

如環境中雌激素含量情況、父母雙方年齡是否較大、有無保胎、是否為低出生體重兒等，這些都可能致使胎兒發育異常而引起小兒尿道下裂。

小兒尿道下裂的成因包括多種，有相關家族史要重視備孕基因檢測和孕期產檢，患兒確診后應盡快手術，以避免不良影響。