肛門指檢和肛門鏡檢是兩種不同的檢查方法，其區別主要體現在檢查手段、觀察內容等方面。

1.檢查手段

肛門指檢是醫生用手指進行觸診，通過手指的觸覺來判斷肛門和直腸內部的情況。而肛門鏡檢則是醫生使用肛門鏡，這是一種特殊的檢查工具，通過其可以直觀地觀察到肛門和直腸內部的情況。

2.觀察內容

肛門指檢主要是檢查肛管直腸里是否有新生腫物、同時是否有黏膜松弛、肛門括約肌的張力狀態、以及齒線區是否有飽滿搏動感等。而肛門鏡檢主要是觀察黏膜情況，如黏膜色澤、血管叢分布情況，以及是否有潰瘍、膿點、缺血的表現等，還可以觀察內痔的分布情況以及其充血、肥大、增生程度、以及痔核分布情況等。