重復陰莖病因未明，所以沒有有效的預防措施，但是女性懷孕期間避免接觸有毒有害物質、避免私自服用致畸藥物、定期產檢等措施可以在一定程度上避免重復陰莖畸形的發生。

1、避免接觸有毒有害物質

懷孕期間女性避免長時間接觸苯、甲醛、油漆等有毒有害物質，避免不必要的放射線檢查可以降低胎兒出現畸形的概率。

2、避免私自服用致畸藥物

懷孕期間避免私自服用四環素類藥物、激素類藥物、抗結核藥物等，以免導致胎兒畸形。

3、定期產檢

孕期定期產檢，了解胎兒的生長發育情況，若在孕早期、孕中期發現胎兒有重復陰莖及合并其他多處畸形，必要時，為了符合優生優育原則，可以考慮終止妊娠。