食管胃底靜脈曲張的主要病因是門靜脈高壓，發病原因常見肝前因素、肝內因素、肝后因素，具體如下：

1、肝前因素

門靜脈或脾靜脈血栓栓塞或是腫瘤壓迫，會引起門脈高壓癥，由于門靜脈與腔靜脈間的交通支逐漸擴張，從而引起食管胃底靜脈曲張。

2、肝內因素

通常和肝硬化有關，如酒精性肝硬化、肝豆狀核變性肝硬化等，肝癌患者也會有食管胃底靜脈曲張。

3、肝后因素

常見有肝靜脈阻塞、慢性充血性心力衰竭、縮窄性心包炎等。