原發性腦干損傷的癥狀包括意識障礙、錐體束征、瞳孔變化、眼球位置與運動異常等。

1、意識障礙

患者受傷后立即發生昏迷或者深昏迷，受傷越嚴重，昏迷程度越深。

2、錐體束征

早期表現為軟癱、反射消失、肌張力增高和腱反射亢進，晚期可出現肌張力消失、深反射消失等癥狀，通常提示病情危急。

3、瞳孔變化

腦干損傷后患者的雙側瞳孔大小不等、瞳孔形態不規則。

4、眼球位置與運動異常

中腦損傷時可導致眼球分離；腦橋損傷可導致雙眼向一側凝視；丘腦底部、中腦四疊體損傷時兩眼可向下方凝視。