流行性腦炎多傳播于亞洲的東部亞熱帶以及溫帶的國家，主要是蚊蟲媒介進行傳播，主要發生于夏秋季。在蚊蟲肆虐的時候，當人體被帶病毒的，就是帶有乙型腦炎病毒的蚊蟲叮咬之后，病毒會在皮下的局部組織繁殖。

通過機會進入血流，在血管內皮細胞淋巴結，脾臟，腎臟甚至是骨髓等內臟進行進一步的繁殖。

當人體的抗病能力比較強時，可能不會有明顯的臨床癥狀，病毒會在短暫的病毒血癥之后就要被消滅，當人體的抵抗力降低或者是小十歲以下的兒童抵抗力以及機體的免疫力并沒有完全完善時，就會出現大量的病毒感染。

這樣的話，經過血液的循環，就通過破壞的血腦屏障，侵入到中樞神經系統，就會引發廣泛的改變。而蚊蟲媒介的傳播，在這種潛伏期4到21天之后，就會逐步的出現。