打完流腦疫苗后發燒可以通過一般護理、藥物治療以及及時就醫等方法來進行處理，流腦疫苗是預防流行性腦脊髓膜炎的有效措施，屬于滅活疫苗，接種后部分人群會出現一過性的低燒，通常不需要特殊處置，幾天后會自行消失。

1、一般護理

如果接種疫苗后發燒但溫度沒有超過38.5℃，也沒有痙攣等其他不適癥狀，建議適當臥床休息，多補充水分和維生素C，促進排汗，有利于體溫的下降。也可使用溫熱的毛巾擦拭手心、腳心、額頭等處，或者使用退燒貼貼于頭部，進行物理降溫；

2、藥物治療

如果體溫超過38.5℃，可以使用阿司匹林、尼美舒利、對乙酰氨基酚等藥物進行治療，如果出現比較明顯的高燒，可以使用復方氨基比林、賴氨匹林肌肉注射或靜脈注射退燒；

3、及時就醫

如果出現高燒不退，或伴有精神不振、嗜睡，或者出現皮疹、呼吸困難等癥狀，可能是感染或過敏反應所引起，建議及時到醫院就診。

體弱的患者服用退燒藥后，常引起大量出汗，此時需要格外注意，應該每半個小時測一次體溫，觀察體溫變化的情況，大多數患者可在數小時內體溫下降至正常。