引起脊髓空洞癥的原因有以下幾種：

第一、先天性發育異常。脊髓空洞癥患者常伴有畸形，比如小腦扁桃體下疝、脊柱裂等，因此脊髓空洞癥被認為是脊髓的先天性發育異常。

第二、腦脊液動力學異常。腦脊液是一種無色透明的液體，包繞在腦和脊髓周圍，正常情況下腦脊液不斷循環流動，當由于先天性異常影響腦脊液循環流動時，升高的壓力會沖擊脊髓，導致脊髓出現空洞。

第三、血液循環異常。脊髓血管畸形、脊髓損傷和脊髓炎等引起脊髓的血液循環異常，導致脊髓缺血壞死，形成空洞。

第四、其他發病原因。比如腦膜炎、脊髓腫瘤、蛛網膜囊腫、椎管狹窄癥，也可以引起脊髓空洞癥。