腦炎的后遺癥包括運動功能障礙、失語、認知功能障礙等。

1、運動功能障礙

炎癥累及至大腦運動功能皮質區，可引起運動功能障礙，表現為震顫、角弓反張、手足徐動、偏癱、共濟失調等。

2、失語

炎癥累及至大腦言語功能皮質區，可引起失語，表現為理解困難、閱讀困難、說話困難、復述困難等。

3、認知功能障礙

若支配記憶和認知的腦組織受到損害，會導致機體認知功能出現障礙，表現為人格改變、記憶喪失、情感淡漠、表情呆滯等。