宮頸癌疫苗2價、4價、9價的主要區別是預防人乳頭瘤病毒亞型不同。

宮頸癌疫苗2價預防HPV16、HPV18。宮頸癌疫苗4價可以預防HPV6、HPV11、HPV16、HPV18。宮頸癌疫苗9價除了可以預防HPV6、HPV11、HPV16、HPV18外，還可以預防HPV31、HPV33、HPV45、HPV52、HPV58。宮頸癌疫苗2價、4價、9價在其他方面并無明顯區別，這三種類型的疫苗適齡接種人群均為9-45歲女性。

宮頸癌疫苗并不能起到百分之百預防效果，所以女性在接種宮頸癌疫苗后仍然要做好防護措施，比如避免發生不潔性行為、擁有固定性伴侶等。