治療幼兒自閉癥的方法主要為行為訓練及認知干預等，如有必要，方可謹慎使用藥物進行治療。通常年齡較小的幼童心智尚未成熟，此時可通過各類的行為訓練方法促使其恢復正常的社交，同時幫助其形成基礎的交流能力。再者，家屬也需注意端正自身行為，利用幼童天生的模仿行為使其恢復正常的表達能力及活動能力。而癥狀較為嚴重的幼童則還可在認知訓練間隙及出現應激反應時，使用精神藥物進行治療。