丘腦出血的后遺癥主要表現為感覺障礙，一般會導致患者肢體感覺衰退，并且會有自發性疼痛，臨床上稱為自發性丘腦痛。如果患者是優勢半腦的丘腦出血，可能會出現失語癥狀或者是發音困難、復述比較差等。若是非優勢半球受累，可能會有偏側的復視。部分患者還會出現精神障礙等癥狀，比如情感淡漠、情緒低落等，比較嚴重的會有丘腦性癡呆，此時會有記憶力減退、性感障礙、人格改變等情況。