尖銳濕疣目前臨床上用來治療的藥物有3.75%或5%的咪喹莫特乳膏、0.15%或0.5%鬼臼毒素乳膏、30%到50%三氯醋酸溶液、干擾素。鬼臼毒素乳膏適用于數量少、疣體小的尖銳濕疣，使用前先用油質抗菌藥膏保護皮損周圍的正常皮膚或黏膜，再用鬼臼毒素乳膏。咪喹莫特乳膏是一種免疫調節劑，有產生免疫調節和抗病毒作用。干擾素局部外用對小的尖銳濕疣有一定效果。三氯醋酸溶液可以將疣體腐蝕脫落。