肝膿腫疾病和原發性肝癌、膽道感染以及右膈下膿腫等疾病有相似點，需要進行鑒別診斷。肝膿腫沒有出現完全液化的現象時，其進行影像學檢查，和肝癌較為相似，此時需要進行ct、磁共振以及肝穿刺活檢來鑒別診斷。膽道感染患者的癥狀和肝膿腫較為相似，患者會出現右上腹絞痛、皮膚鞏膜黃染等癥狀，可以進行腹部超聲以及ct檢查來診斷，右膈下膿腫好發于腹腔感染后，臨床癥狀也和肝膿腫相似。