延髓梗死的患者早期需要給予溶栓治療，常用的藥物有阿替普酶。還需要使用抗血小板凝集的藥物，如氯吡格雷、阿司匹林等。發病的6小時可以使用改善腦血管的藥物，如尿激酶，以及營養神經的藥物，如胞二磷膽堿、興奮性氨基酸受體阻斷劑等。如果有基礎疾病的患者，還需要給予降血壓、降血糖、降血脂的治療，在治療腦梗死時需要嚴密的觀察生命體征。必要時需要進行手術治療。