引起血管瘤的原因通常考慮是先天性因素導致。胚胎在血管生成時受到外界化學藥物等因素的侵襲，導致血管變化異常、畸形發育；其次皮膚外傷在恢復時，會產生新生毛細血管也會導致血管瘤的發生。

血管瘤具體的病因仍不明確，通常認為是由于胚胎早期發育階段，由于基因出現小范圍錯構，從而導致局部組織的分化異常，引起血管瘤的產生；還可能與妊娠期高血壓、嬰兒出生時體重較低等因素有關。