任何操作都會存在一定的風險，比如在進行無痛腸鏡檢查的時候，需要在檢查前注射麻醉藥，如果患者對麻醉藥不耐受，或者對麻醉藥過敏的時候，都會引起不適，嚴重的時候還會引起休克。

做無痛腸鏡是臨床上比較常見的檢查方式，可以有效反應出腸道的情況，無痛腸鏡相對于傳統的檢查方式而言，其安全性比較高，所以不會有太大的危險，避免情緒過于緊張，檢查的當天早晨禁食禁水，注意休息。