小腦蚓部發育不良一般是基因異常造成的。也可能是卵子異常或者女性懷孕期間被病毒感染造成的。夫妻雙方在懷孕前最好去醫院做孕前檢查，確定身體內沒有影響懷孕的因素，以免胎兒生長發育異常。

胎兒出現小腦蚓部發育不良，往往是因為染色體異常，卵子異常，或者是病毒細菌感染引起的，除此以外，如果孕婦接受到了強輻射的射線，或者服用了一些有害的藥物，都容易導致胎兒出現畸形的發育，這種疾病患兒的生存幾率較小，所以可以在醫生的指導下及時的進行相關的干預。