如果囊腫的體積非常小，可能不會出現任何臨床癥狀。如果囊腫的體積比較大，對腹壁進行了牽拉，可以導致明顯的腹痛。還會出現腰部酸脹，囊腫破裂還可以導致血尿，還可能會合并有感染。

腎臟作為人體的重要器官之一，雖然每個人有兩個腎，但是一旦出現問題，對身體帶來巨大影響。由于腎臟代償功能強大，所以腎囊腫患者通常沒有明顯的不適癥狀。即使有些患者偶然出現腰酸背痛，也往往因為生活和工作上的壓力而忽視了。正因為忽視了癥狀，往往導致腎囊腫在體內增大，壓迫到腎臟，使腎臟結構受到損害，減少腎單位數目，這時就出現了腎衰竭。