結腸癌肝轉移主要的治療方法是通過手術肝切除治療。對于手術不能耐受患者主要選擇化療以及靶向治療，一般化療藥物選擇亞葉酸鈣、5-氟尿嘧啶，再根據基因檢測選擇靶向藥物，如西妥昔單抗等。

對于結直腸癌和肝轉移患者，當有手術指征且患者一般能耐受手術時，目前建議手術治療，對于不能手術切除或不能耐受手術的患者，主要選擇全身治療，包括化療和靶向治療相結合，結腸癌和肝轉移患者的全身治療與晚期結腸癌相同，常用的化療藥物有5-氟尿嘧啶、亞葉酸鈣等。