細菌和真菌是完全不同的生物體，包括結構、形狀、營養方式等等。臨床上雙方感染出現的癥狀也不同，細菌感染時多出現高熱、關節疼痛等癥狀；真菌感染時多表現為體表皮癬，如手足癬等。

細菌和真菌感染是有很大的區別的，細菌感染比較容易根治，如果是真菌感染的情況下是不容易根治的，細菌感染的時候吃點抗生素方面的藥物就可以得到很好的效果。如果有甲溝炎，一般情況下是細菌感染，但是如果有灰指甲或者本身有真菌感染的情況下，也不能排除甲溝炎，有真菌性的感染。