鹽酸小檗堿主要針對(duì)于胃腸道細(xì)菌感染治療，患者服用后通常會(huì)有輕微的惡心，部分人會(huì)嘔吐。對(duì)于有藥物過(guò)敏反應(yīng)的患者，可能會(huì)有皮疹產(chǎn)生。如果出現(xiàn)嚴(yán)重不良反應(yīng)，建議及時(shí)就醫(yī)，過(guò)敏體質(zhì)的人需要咨詢(xún)專(zhuān)業(yè)醫(yī)生。

長(zhǎng)期服用鹽酸小檗堿可能會(huì)影響胃腸道的吸收消化功能，破壞人體對(duì)維生素及脂肪酸的吸收。部分患者會(huì)有惡心、嘔吐以及藥熱的不良反應(yīng)，但是停藥后癥狀會(huì)立即消失。建議不要長(zhǎng)時(shí)間或者過(guò)量服用。