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肥厚性心肌病的病因，目前認為遺傳因素是最主要的病因，其依據是本病有著明顯的家族性發病傾向，而且常常合并其它的先天性心血管畸形，有些患者出生時就發現有肥厚性心肌病，而有的患者是到成年以后，才發現肥厚性心肌病。
本病患者中可見到HLA抗原的遺傳基因型，家族性病例以常染色體顯性遺傳形式進行傳遞，發病的形式可是無癥狀的心肌不對稱性肥厚，也可以是有典型的梗阻癥狀，大約50%-55%的肥厚性心肌病患者都有家族史屬于常染色體顯性遺傳病，目前肥厚心肌病的遺傳學已被公認，而且認為以組織相容性抗原系統有著密切的關系。
（ 養生 ）
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