錯頜畸形是一種發育畸形，病因較復雜，一般由遺傳因素和環境因素所造成。據調查統計，錯頜畸形中的60%-70%是由后天環境因素引起的，因此錯頜畸形中的多數是可以預防的，主要應做到以下幾點：
1、糾正嬰幼兒不良習慣。
首先是去除不良習慣的病因，對發生不久、持續時間不長的不良習慣，經過父母引導提醒和耐心說服，是不難改正的。必要時使用各種不良習慣破除器，幫助孩子克服不良習慣。
2、注意幼兒身心健康，加強營養并重視口腔衛生。
及時發現和治療全身性疾病，如佝僂病、消化不良、內分泌失調及鼻咽部慢性炎癥等，早期充填齲齒，這也是預防孩子錯頜畸形的方法之一。
3、從優生學上解決由遺傳導致的錯合畸形。
注意母體的營養保健，預防母體疾病，是保證胎兒正常發育的先決條件。胎兒出生時，防止產時的外傷。