導致尿道畸形的原因很多，有先天性因素和后天性因素，先天性因素引起的有先天尿道下裂，它是一種較常見的先天畸形。根據尿道口的部位，將尿道下裂分為陰莖頭型、陰莖型、陰囊型及會陰型，其中陰莖頭型及陰莖型占多數。尿道下裂是男性嬰幼兒中尿道和外生殖器最常見的先天畸形，有遺傳性。發病率約為300個男嬰中有一個發生。本病陰莖短小，向腹側彎曲，需手術整形，否則會影響排尿和以后的性功能。值得注意的是，這種疾病手術的最佳時機是患兒18個月到3歲的時候，最大不要超過四五歲，因為年齡越大手術難度越大，而且術后容易引起尿漏、尿道狹窄等并發癥。
尿道畸形的治療主要是解除下尿路梗阻，控制感染。該疾病的治療周期較長，患者應對治愈這種病很有自信，切不可因此而產生心里上的壓力。同時為了避免在治療過程中出現意外，家長帶孩子去正規的醫院進行治療。值得注意的是，該病越早治療，對患者尿道畸形危害以后就越小。