腦癱患兒常出現下肢的畸形，嚴重的畸形通過康復訓練不能矯正，需要進行下肢矯形術進行治療，之后再開始康復訓練，才能取得較好的治療效果。腦癱下肢矯形術的術式繁多，常見的術式包括髖關節脫位復位術、股骨截骨術，足踝部跟距關節融合術。
腦癱患兒的髖關節脫位不同于先天性髖關節脫位等其他原因所致的脫位，其原因是髂腰肌和內收肌群持續性強力收縮、痙攣而逐漸使股骨旋出髖窩。腦癱兒長期處于髖關節脫位的狀態，會嚴重影響髖關節的正常發育，需要早期進行手術治療。一期手術主要是松解痙攣的肌肉群，使下肢能伸直，外展時可以達到15°。之后進行二期手術，在手術中重建髖關節，恢復正常的髖關節功能。
如果腦癱患兒髖關節極度內收，可以行股骨轉子下外展截骨同時矯正旋轉畸形。采用股骨截骨術治療腦癱下肢畸形，可以幫助患兒下肢恢復為功能位，有利于康復訓練的正常進行。
足踝部跟距關節融合術主要針對于腦癱患兒的馬蹄內翻足，一般在患兒12歲以內進行手術，如果超過12歲，經過手術一般也不能解除畸形。