婦科專家表示，習慣性流產有別于一般偶發性流產。它的原因包括遺傳因素、感染、子宮發育異常、內分泌失調、免疫系統異常等，還有一些是不明原因的。其癥狀和一般流產無異，在治療上，就要以診斷結果為依據了。
遺傳因素占習慣性流產的6%。一般來說，遺傳因素是指基因異常，原因在于夫妻兩人可能帶有異常基因，但只是攜帶者，沒有癥狀顯現，精卵結合后，異常基因的存在就可能導致胚胎異常而致流產。
治療異常基因無法根除，但是精卵結合仍有機會為正常基因，可嘗試懷孕，等妊娠較大月份后再行基因診斷。專家表示，想為人父母者，如果發生不明原因的自然流產，就應做相應的檢查了解雙方是否帶有異常基因。