生殖器皰疹的預防有其自身的特點，要強調咨詢和健康教育。
1、咨詢
(1)解釋本病的自然病程，強調其復發性和無癥狀排毒的可能性，無癥狀期間也可發生HSV性傳播;
(2)告訴病人本病復發的常見誘因，避免心理緊張、郁抑或焦慮等不良情緒，通過避免復發誘因可減少復發;
(3)告知育齡期病人(包括男性病人)有關胎兒和新生兒HSV感染的危險性;
(4)告訴初發病人，抗病毒治療可縮短病程，抗病毒抑制療法可減少或預防復發;
(5)取得病人對治療的積極配合，以減少疾病的繼續傳播。
2、健康教育
(1)強調病人將病情告知其性伴，取得性伴的諒解和合作，避免在復發前驅癥狀或皮損出現時發生性接觸，或更好地采用屏障式避孕措施，以減少HSV傳染給性伴的危險性;
(2)提倡安全套等屏障式避孕措施，安全套可減少生殖器皰疹傳播的危險性，但皮損出現時性交，即使使用安全套也可能發生HSV性傳播;
(3)改變性行為方式，避免非婚性行為，杜絕多性伴，是預防生殖器皰疹的根本措施。