前列腺痛與其他幾種前列腺疾病有相似之處。前列腺痛是威脅男性朋友身體健康的一大因素，前列腺痛患者要盡量到專業的男科醫院去進行檢查治療，以便采取有針對性的治療措施。我們怎樣進行前列腺痛的鑒別診斷呢?
1、畸形細菌性前列腺炎(ABP)的癥狀較為典型，不易于前列腺痛及CNBP相混淆。
2、前列腺痛、CBP及CNBP三者的癥狀非常相似，許多主訴排尿困難和排尿疼痛、白天尿頻和夜尿增多等刺激性癥狀，這些癥狀的嚴重程度可隨時間而變化。CBP及CNBP的EPS鏡檢白細胞均≥10個/HP，而前列腺痛的患者EPS中白細胞﹤10個/HP，EPS及尿沉渣鏡檢無細菌，尿細菌培養應為陰性;而CBP則因為可能有菌尿故常規鏡檢時白細胞異常增高，尿沉渣鏡檢可能有細菌，尿培養可能有細菌生長。
3、既往病史中，抗生素治療或其他非特異性治療對癥狀的緩解程度是前列腺痛診斷和鑒別診斷的中重要病史資料。大多數CBP在進行抗生素治療后可使癥狀完全緩解，這種癥狀的改善得益于尿液中細菌的清除，而與前列腺感染的細菌學變化無關。然而，如果治療沒有徹底，感染的的癥狀會在數月內再發。已有的證據表明，一些CNBP和前列腺痛在行抗生素治療后也可緩解。然而，與CBP不同的是這種癥狀的緩解是短暫的或類似于治療不徹底的CNBP。CNBP或前列腺痛常常對非特異性治療有較好反應。
4、間質性膀胱炎和膀胱原位癌有時可與前列腺痛的癥狀相似，通過病史、體檢和前列腺液分析，如果不能排除或提示上述疾病可考慮做膀胱鏡檢查和或組織檢查，以及尿液脫落細胞學檢查等以助鑒別。