男性不育因其不是一種獨立疾病，發病原因也就復雜多樣，所以男性不育的診斷過程也是非常復雜的，對于不育癥患者，它同時也是最為重要的環節，因此不育患者在診斷病情時應做如下檢查項目：
1、觀察外生殖器：在男性不育的診斷時，首先要觀察陰莖的大小、睪丸質地軟硬度及大小、尿道有無下裂，在觸摸附睪時有無疼痛和囊腫。必要時可以做肛診，來確定前列腺的質地和大小。
2、體格檢查：一般男性不育患者的體格檢查包括體重、身高、乳、陰毛、腋毛、喉結等生長情況的檢查。
3、精液的生化檢查：這項檢查可以反映精囊、附睪、前列腺的功能。檢查精子質量的方法還有精子爬高試驗、檢查精液和血液中是否存在抗精子抗體，需要做精子凝集試驗。
4、精液質量檢查：許多引起不育的病因都會從精液檢查結果體現出來，應重復檢查，如果檢查結果顯示精子數量異常等，說明精液的質量不正常。
因男性不育的診斷結果，對進一步的治療來說影響重大，所以它要求有較高的醫療設備和較高的醫學水平，因此建議廣大患者一定要到正規的醫院予以診療，以免因診斷錯誤，而影響治療效果。