核磁檢查具有軟組織高分辨率的特點，用于顱腦和脊髓檢查優于CT，在脊椎矢面、軸面和冠面等均可掃描成像。脊椎結核MRI表現病變的椎體、間盤和附件與正常的脊椎對應處的正常信號相比，高于者為高信號，低于者為低信號。
1.椎體病變
加權像顯示病變處為低信號，或其中雜有短T1信號。椎體病變T2加權像顯示信號增強。圖像顯示有病變椎體除信號改變外，可見椎體破壞的輪廓、椎體塌陷后順列改變和擴大的椎旁影像等。
2.椎旁膿腫
脊椎結核椎旁膿腫在T1加權像顯示低信號，而T2加權像呈現較高信號。冠面能描繪出椎旁膿腫或雙側腰大肌膿腫的輪廓與范圍。
3.椎間盤改變
脊椎結核X線攝片間盤變窄是早期征象之一。MRI的T1加權像呈現低信號變窄的間盤。正常的髓核內在T2加權像有橫行的細縫隙，當有炎癥時這細縫隙消失，能早期發現間盤炎癥改變。
MRI在早期脊椎結核的診斷較其他任何影像學檢查包括ECT在內更為敏感。臨床癥狀出現3～6個月，疑內脊椎結核病人，X線攝片無異常，MRI可顯示受累椎體及椎旁軟組織(膿腫)，T1加權像為低信號，T2加權像為高信號。
早期脊椎結核MRI影像可分為三型
①椎體炎癥;
②椎體炎癥合并膿腫;
③椎體炎癥、膿腫合并椎間盤炎。值得提出受累椎體處于炎癥期，而無軟組織和椎間盤信號改變者，不能與椎體腫瘤相鑒別，必要時應行活檢證實。