在臨床上，有時因為牛皮癬與扁平苔蘚這兩種疾病表現的很相似，所以容易出現誤診。為了區分這兩種疾病，將二者的區別整理如下。
1、牛皮癬出現慢性肥厚性皮損時可能與慢性局限性扁平苔蘚似，但牛皮癬皮損表面鱗屑多，易被刮除，鱗屑刮除后可到薄膜，再刮去薄膜，可見到點狀出血;
扁平苔蘚病理有特征性改變，表現為表皮角化過度，顆粒層增厚，棘細胞層不規則增厚，基底細胞液化變性以及真皮上部呈帶狀浸潤是診斷扁平苔蘚的重要依據。而牛皮癬的病理改變主要為角化不全及在角層內或角層下由白細胞構成的小膿腫。
2、牛皮癬的皮損呈點滴狀或圓形狀的紅丘疹，而扁平苔癬的皮損是從紅到紫色，有時是正常皮色的扁平、多角形、發亮的丘疹;
3、牛皮癬不會產生脫發，扁平苔蘚發生于頭皮時可引起永久性禿發;
4、牛皮癬的丘疹上覆蓋鱗屑，沒有光澤：扁平苔蘚的丘疹表面有一層光亮的蠟樣薄膜，并可見細的白色條紋，若在表面搽些油后再看會更明顯;
5、扁平苔蘚主要累及腕和踝的屈側：常見一個先驅斑。扁平苔蘚主要累及腕和踝的屈側，皮疹常呈明顯的紫色，深膚色患者的皮疹趨于顯著色素沉著。指(趾)甲不像牛皮癬形成凹窩，但可出現縱嵴、粗糙及增厚。翼狀胬肉形成扁平苔蘚特征;
6、扁平苔蘚消退后常留有表淺萎縮痕跡，中央下凹并有色素沉著;牛皮癬消退后則僅留輕度的色素沉著或色素減退或無任何痕跡。