1、卵巢非贅生性囊腫 如卵泡囊腫、黃體囊腫等，一般直徑小于5cm，壁薄，多在1～2個月自然消退。
2、子宮肌瘤 卵巢腫瘤有可能與子宮肌瘤囊性變或漿膜下子宮肌瘤混淆。B超檢查可明確診斷。
3、早孕 子宮增大變軟，有停經史，hCG值升高可確診。B超見有胚囊或胎心博動。
4、慢性尿潴留 多有排尿困難或尿不凈病史，包塊位于下腹正中，邊界不清，導尿后包塊即消失，亦可用B超檢查鑒別。
5、附件炎性包塊 有慢性盆腔炎與不育史，包塊位置較低，有觸痛，與子宮有粘連。
6、腹水與結核性腹膜炎(包裹性積液)與巨大卵巢囊腫鑒別。
巨大卵巢囊腫、腹水、結核性腹膜炎(包裹性積液)鑒別診斷
卵巢囊腫 腹水 結核性腹膜炎
病史
自覺有腫塊自下腹一側開始逐漸增大無腫塊，多繼發于肝、腎、心臟器官疾病，腹部漸膨大低熱，消瘦、消化道癥狀明顯,常閉經，腹部漸膨隆
腹部檢查
視 診腹部向前突起，兩側較平兩側外突，中間較平，如蛙腹不定
觸 診可摸到腫塊，巨大囊腫則不易捫清摸不到腫塊有揉面感或有不規則塊狀物
叩 診兩側鼓音，中間濁音，無移動性濁音兩側實音，中間鼓音，有移動性濁音濁音與鼓音界限不定
婦科檢查子宮多被頂向前，不活動，后穹窿可捫及囊壁子宮有浮球感子宮附件可正常，也可與腸管粘連而摸不清 B 型超聲圖像圓形液性暗區，邊界整齊，光滑不規則液性暗區，其中有腸道光團浮動不規則囊性液性暗區，壁常為腸管光團組織 X 線胃腸造影胃腸多被臍向外上方腸管漂浮，活動度大，無占位病變腸管粘連不易推開